高效空气过滤器主要是作为一种工业耗材，种类及结构也很多，其中，高效空气过滤器的高校结构又有无隔板和有隔板的区别，分别形成无隔板高效空气过滤器和有隔板高效空气过滤器两种不同的类型。
无隔板的高效空气过滤器主要采用的是热溶胶作为滤芯的分隔物，这种以热熔胶作为过滤器滤芯的分隔物更便于机械化的生产。加上无隔板的高效空气过滤器体积较小、重量轻、便于安装、效率稳定、风速均匀的特点，所以，一般情况下的洁净厂房比较多采用的是无隔板结构的高效空气过滤器。V型密褶式过滤器用于一般通风系统，具有过滤面积大，阻力低，使用寿命长等特点。它可做为高效过滤器的预过滤器使用，从而有效延长高效过滤器的使用寿命。
有隔板的高效空气过滤器，主要采用的是铝箔和纸做成的折叠状作为滤芯的分隔物，从而形成一种空气通道，并且分隔板还有采用优质牛皮纸的等等。其中，以铝隔板过滤器主要用于高温或高湿环境，纸隔板过滤器用在普通洁净环境。并且以双面上胶的铜版纸作分隔板，防止了分隔板受冷热干湿的影响发生收缩从而散发颗粒，以这种为滤芯分隔物的高效空气过滤器，同时这些分隔物又与木框或铝合金框胶和，形成了过滤效率高、阻力低、风量大的特点。